Les habitats d’intérêt communautaire représentent 75% de la surface du périmètre du site Natura 2000. Ces milieux sont majoritairement des milieux ouverts dont les principales menaces sont la déprise agricole qui engendre la fermeture de ces espaces et la destruction directe de l’habitat (conversion en parcelles boisées ou reconversion en prairies temporaires). Quelques espaces boisés s'ajoutent à ces espaces ouverts comme le bois du Crozat.
12 habitats d’intérêt communautaire (HIC) sont inscrits à l’annexe I de la Directive 92/43/CEE « Habitats Faune Flore » dont 3 prioritaires (*) à savoir : Landes humides à Bruyère à quatre angles
- Landes sèches, Landes à Genévrier
- Pelouses à Nard raide (*)
- Hêtraies atlantiques acidiphiles
- Forêts marécageuses (*)
- Prairies à molinie
- Tourbières hautes à peu près naturelles (*)
- Tourbières à Molinie bleue
- Tourbières de transition
- Communautés à Rhynchospore blanc
- Formations à Littorelles